3月3日 由国家计委副主任包叙定带领的国家计委、交通部调研组在珠海市听取伶仃洋大桥可行性研究和珠海港建设进展情况，市委常委、副市常委、副市长冼文，副市长周本辉和有关方面负责人参加了汇报。

7月8日 市委、市政府发文，同意《珠海管理区、珠海港务局及珠海港口企业体制改革方案》（珠字[1999]24号），珠海港管理体制改革正式启动。按照政企业、政事、政资分开的原则，原珠海港管理区撤销，成立珠海市临港工业区管理委员会；为进一步加快港区的开发和建设，成立珠海港建设管理委员会，与临港工业区管委会合署办公，实行两块牌子一套人马，原珠海港区的行政职能由珠海临港工业区管委会行使；港区管辖的南水镇和南通公司划归三灶管理区管管辖；在对珠海港管理区的管理体制进行改革的同时，实施撤销珠海港务局，成立珠海港务管理体制进行改革的同时，实施撤销珠海港务局，成立珠海港务管理局，与珠海市交通委员会合署办公。珠海市港务管理局为市政府管理港口行业的办事机构，是港口企业的业务指导机构。与此同时，撤销珠海市港务集团公司，组建珠海市港口企业集团有限公司。港口企业集团公司由市国有资产经营管理局负责组建，按上市公司要求进行资产重组，并按现代企业制度进行改革。

7月28日 珠海临港工业区管委会和珠海港建设管理委员会正式挂牌运作。市委副书记雷于蓝、市委组织部部长李素芝等出席挂牌仪式。珠海临港工业区管委会作为全市五大经济功能区之一，行使市一级经济管理权限，主要任务是进一步完善高栏港基础配套设施的建设；加大招商引资力度，以高栏深水大港为依托，发展临港工业和国际性仓储保税业。

8月17日 珠海发电厂首期两台发电机组1号机70万千瓦机组正式并网发电。

12月15日 台湾长兴化工有限公司与南水镇签订合同，在临港工业区办树脂厂。